L'Alliance Evangélique, née au sein des Eglises issues de la Réforme, est internationale et interdénominationnelle. Elle s'est constituée à Londres, en 1846, lors d'une Conférence mondiale à laquelle participaient un millier de pasteurs représentants une cinquantaine de dénominations.
La délégation française comprenait une dizaine de personnes dont les pasteurs Ami Bost, Emilien Frossard, Adolphe Monod, Antoine Vermeil, Georges Fisch...
Les fondateurs voulaient manifester la réalité de leurs liens en dépit de leur diversité. Sans chercher à créer une nouvelle Eglise (l'Alliance Evangélique n'est pas une nouvelle dénomination), mais, conscients de leur unité, ils aspiraient à cultiver entre eux et les Eglises qu'ils représentaient des rapports fraternels, fondés sur une déclaration de foi précise.
L'Alliance Evangélique Française s'est aussitôt organisée en France, d'abord à Lyon, puis à Paris... Au nombre de ses présidents notons les pasteurs Eugène Bersier, Ruben Saillens, Daniel Couve, Jean-Paul Benoît..., et plus récemment André Thobois, Jean-Jacques Weiler, Claude Grandjean.
L'Alliance Evangélique Française est membre de l'Alliance Evangélique Européenne et de l'Alliance Evangélique Universelle.